Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms