Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms