Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms