Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP2

CMC2, COX assembly mitochondrial protein 2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC2Q9NRP2 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms