Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTPS2Q9NRF8 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms