Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
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FOXQ1Q9C009 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
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FOXQ1Q9C009 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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FOXQ1Q9C009 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
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FOXQ1Q9C009 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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