Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms