Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms