Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIOK2Q9BVS4 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIOK2Q9BVS4 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIOK2Q9BVS4 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIOK2Q9BVS4 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIOK2Q9BVS4 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIOK2Q9BVS4 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
RIOK2Q9BVS4 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
RIOK2Q9BVS4 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RIOK2Q9BVS4 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
RIOK2Q9BVS4 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms