Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms