Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NDFIP1Q9BT67 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDFIP1Q9BT67 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms