Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms