Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms