Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms