Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYCBPQ99417 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms