Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms