Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms