Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX0

CMTM3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3Q96MX0 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CMTM3Q96MX0 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CMTM3Q96MX0 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CMTM3Q96MX0 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CMTM3Q96MX0 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CMTM3Q96MX0 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CMTM3Q96MX0 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CMTM3Q96MX0 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CMTM3Q96MX0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CMTM3Q96MX0 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CMTM3Q96MX0 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CMTM3Q96MX0 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CMTM3Q96MX0 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CMTM3Q96MX0 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CMTM3Q96MX0 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CMTM3Q96MX0 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CMTM3Q96MX0 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CMTM3Q96MX0 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CMTM3Q96MX0 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CMTM3Q96MX0 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CMTM3Q96MX0 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CMTM3Q96MX0 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CMTM3Q96MX0 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CMTM3Q96MX0 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CMTM3Q96MX0 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CMTM3Q96MX0 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CMTM3Q96MX0 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CMTM3Q96MX0 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CMTM3Q96MX0 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CMTM3Q96MX0 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CMTM3Q96MX0 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CMTM3Q96MX0 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CMTM3Q96MX0 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMTM3Q96MX0 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMTM3Q96MX0 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMTM3Q96MX0 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMTM3Q96MX0 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMTM3Q96MX0 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMTM3Q96MX0 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMTM3Q96MX0 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMTM3Q96MX0 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CMTM3Q96MX0 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMTM3Q96MX0 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMTM3Q96MX0 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMTM3Q96MX0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMTM3Q96MX0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMTM3Q96MX0 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CMTM3Q96MX0 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMTM3Q96MX0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMTM3Q96MX0 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMTM3Q96MX0 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMTM3Q96MX0 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CMTM3Q96MX0 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CMTM3Q96MX0 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMTM3Q96MX0 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMTM3Q96MX0 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMTM3Q96MX0 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMTM3Q96MX0 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMTM3Q96MX0 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMTM3Q96MX0 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMTM3Q96MX0 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMTM3Q96MX0 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMTM3Q96MX0 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMTM3Q96MX0 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMTM3Q96MX0 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMTM3Q96MX0 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMTM3Q96MX0 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMTM3Q96MX0 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CMTM3Q96MX0 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CMTM3Q96MX0 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CMTM3Q96MX0 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CMTM3Q96MX0 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CMTM3Q96MX0 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CMTM3Q96MX0 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms