Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
STAMBPL1Q96FJ0 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
STAMBPL1Q96FJ0 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms