Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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