Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB1

ELP4, Elongator complex protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP4Q96EB1 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms