Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCG3Q8WXD2 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms