Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms