Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms