Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms