Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms