Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDW7

FAT3, Protocadherin Fat 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT3Q8TDW7 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC10.19□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC10.18□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC10.18□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC10.18□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms