Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms