Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5U1

MS4A15, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 15, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A15Q8N5U1 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A15Q8N5U1 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms