Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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CLIP4Q8N3C7 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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CLIP4Q8N3C7 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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CLIP4Q8N3C7 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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CLIP4Q8N3C7 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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