Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms