Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRCQ7RTU9 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms