Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HECW1Q76N89 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms