Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZR52

ZNF493, Zinc finger protein 493, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF493Q6ZR52 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF493Q6ZR52 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms