Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms