Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
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