Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FAM78BQ5VT40 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FAM78BQ5VT40 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FAM78BQ5VT40 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FAM78BQ5VT40 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FAM78BQ5VT40 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FAM78BQ5VT40 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FAM78BQ5VT40 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FAM78BQ5VT40 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FAM78BQ5VT40 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FAM78BQ5VT40 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FAM78BQ5VT40 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FAM78BQ5VT40 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FAM78BQ5VT40 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FAM78BQ5VT40 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FAM78BQ5VT40 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FAM78BQ5VT40 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FAM78BQ5VT40 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FAM78BQ5VT40 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FAM78BQ5VT40 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FAM78BQ5VT40 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FAM78BQ5VT40 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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FAM78BQ5VT40 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FAM78BQ5VT40 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FAM78BQ5VT40 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FAM78BQ5VT40 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FAM78BQ5VT40 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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FAM78BQ5VT40 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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FAM78BQ5VT40 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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FAM78BQ5VT40 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FAM78BQ5VT40 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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FAM78BQ5VT40 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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FAM78BQ5VT40 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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FAM78BQ5VT40 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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FAM78BQ5VT40 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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FAM78BQ5VT40 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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FAM78BQ5VT40 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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