Protein–RNA interactions for Protein: Q58A45

PAN3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit PAN3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3Q58A45 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms