Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms