Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms