Protein–RNA interactions for Protein: Q49AG3

ZBED5, Zinc finger BED domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED5Q49AG3 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZBED5Q49AG3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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