Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms