Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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RTN1Q16799 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
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RTN1Q16799 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
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