Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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