Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2B3Q16720 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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