Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms