Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NTRK2Q16620 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
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