Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HMGN3Q15651 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
HMGN3Q15651 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HMGN3Q15651 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HMGN3Q15651 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HMGN3Q15651 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HMGN3Q15651 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HMGN3Q15651 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HMGN3Q15651 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HMGN3Q15651 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HMGN3Q15651 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HMGN3Q15651 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HMGN3Q15651 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HMGN3Q15651 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HMGN3Q15651 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
HMGN3Q15651 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HMGN3Q15651 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HMGN3Q15651 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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