Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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