Protein–RNA interactions for Protein: Q15582

TGFBI, Transforming growth factor-beta-induced protein ig-h3, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBIQ15582 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TGFBIQ15582 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TGFBIQ15582 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TGFBIQ15582 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TGFBIQ15582 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TGFBIQ15582 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TGFBIQ15582 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TGFBIQ15582 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TGFBIQ15582 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGFBIQ15582 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGFBIQ15582 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGFBIQ15582 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGFBIQ15582 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGFBIQ15582 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGFBIQ15582 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGFBIQ15582 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGFBIQ15582 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGFBIQ15582 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGFBIQ15582 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGFBIQ15582 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGFBIQ15582 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TGFBIQ15582 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGFBIQ15582 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TGFBIQ15582 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGFBIQ15582 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGFBIQ15582 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TGFBIQ15582 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TGFBIQ15582 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGFBIQ15582 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGFBIQ15582 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGFBIQ15582 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGFBIQ15582 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGFBIQ15582 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGFBIQ15582 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGFBIQ15582 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGFBIQ15582 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGFBIQ15582 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGFBIQ15582 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TGFBIQ15582 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGFBIQ15582 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TGFBIQ15582 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGFBIQ15582 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TGFBIQ15582 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGFBIQ15582 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGFBIQ15582 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGFBIQ15582 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGFBIQ15582 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGFBIQ15582 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGFBIQ15582 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGFBIQ15582 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGFBIQ15582 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGFBIQ15582 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGFBIQ15582 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGFBIQ15582 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGFBIQ15582 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGFBIQ15582 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGFBIQ15582 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGFBIQ15582 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGFBIQ15582 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGFBIQ15582 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGFBIQ15582 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TGFBIQ15582 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGFBIQ15582 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGFBIQ15582 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGFBIQ15582 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGFBIQ15582 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGFBIQ15582 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGFBIQ15582 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGFBIQ15582 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGFBIQ15582 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGFBIQ15582 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGFBIQ15582 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TGFBIQ15582 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TGFBIQ15582 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TGFBIQ15582 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TGFBIQ15582 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TGFBIQ15582 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TGFBIQ15582 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TGFBIQ15582 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TGFBIQ15582 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TGFBIQ15582 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TGFBIQ15582 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TGFBIQ15582 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TGFBIQ15582 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TGFBIQ15582 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TGFBIQ15582 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TGFBIQ15582 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TGFBIQ15582 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TGFBIQ15582 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TGFBIQ15582 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TGFBIQ15582 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TGFBIQ15582 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TGFBIQ15582 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TGFBIQ15582 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TGFBIQ15582 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TGFBIQ15582 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TGFBIQ15582 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TGFBIQ15582 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TGFBIQ15582 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TGFBIQ15582 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms